问与答:如何追踪新病毒–并将其与疾病联系起来| 地平线杂志


她怀疑并不是所有的病毒都可能有害,而且人体中多种病毒的收集甚至可能是有益的,但这是一个悬而未决的问题,她说。

您可以在人类和动物中猎杀病毒。 是什么让病毒对您如此吸引人?

我想找到人们尚不知道其病因的疾病的病因。 了解病因可为治疗提供选择。 如果疾病是由病毒引起的,我想找到它。

您能举个例子说明您发现的病毒吗?

我在2003年发现了一种新的人类冠状病毒NL63。我们现在知道这是一种典型的冬季病毒,在一月和二月左右感染儿童。 通常,儿童在两岁之前会对这种NL63冠状病毒具有抗体。 成人也终生感染。 这种NL63冠状病毒通常会引起典型的普通感冒症状,例如流鼻涕,打喷嚏,喉咙痛。

您如何找到NL63病毒?

我对新冠状病毒的鉴定始于在荷兰一家医院里看到的一名患支气管炎和结膜炎的孩子。 这个孩子没有重病,被送回家监视。 但是(医院)从孩子的鼻子中收集了一个样本。

有人怀疑这是RSV(呼吸道合胞病毒)感染,但是当实验室尝试检测RSV时,结果却是阴性。 然后进行了所有其他呼吸道病毒测试,这些测试均为阴性。 阿姆斯特丹市政卫生局的实验室要求我查看哪种病毒正在感染细胞。 我发现了一种冠状病毒,并在2003年4月将其命名为NL63。

对于van der Hoek博士来说,当医生标记出一种似乎具有传染性的疾病时,便开始了病毒搜寻。 图片来源-Lia van der Hoek

您如何识别病毒?

那时没有像今天这样的下一代测序。 当我在2001年开始寻找新病毒时,我不得不开发自己的技术来寻找新病毒。当时,我们对未知病毒的蛋白质或遗传密码一无所知。

首先,我们知道病毒很小,因此您可以选择100或200纳米的东西。 然后,我将样本中存在的DNA或RNA乘以。 在那之后,我使用了来自细菌的限制性内切酶,这些酶切成特定的小遗传序列。 将这些小片段的代码与我们已经知道的病毒进行比较,然后可以确定该病毒是否可能是新病毒。

您是如何发现它是冠状病毒?

一旦我(进行了测序),我发现该代码类似于其他冠状病毒,但又有很大的不同以至于是新的。

同年,中国香港爆发了疫情,而加拿大则泛滥成灾。 找到导致这种流行病的病毒,即SARS,花了两到三个月的时间。 当我第一次获得NL63序列时,我发现它与(SARS)病毒相似,我立刻知道这很重要。

NL63之前只有三种已知的人类冠状病毒,另一种是普通感冒病毒OC43和229E,以及SARS冠状病毒。

我有一种假设,即某些病毒可能是有益的。

荷兰阿姆斯特丹UMC的Lia van der Hoek博士

您的方法与其他病毒猎人有何不同?

如今,病毒猎人可以通过从海洋,土壤或动物中取样来轻松地对数百种未知病毒进行测序。 大多数病毒发现者通常会发布新病毒及其外观,然后继续发布下一个病毒。 搜索未知病毒并不困难,但是找到新的相关病毒则很困难。 这就是为什么我只有在与看到患者患有某种疾病且似乎具有传染性的医生接触时才搜索新病毒的原因。

因此,我对NL63的工作方式很感兴趣,因此最终发表了约30篇有关NL63和其他(人类)冠状病毒的研究。 我喜欢确定一种新病毒会导致什么疾病,以及它会多久发生一次。

您还发现了哪些其他病毒?

自NL63以来,我们发现了更多病毒。 我发现的另一个是鲈鱼,原来是引起鳞屑病的原因。 它是一种虹膜病毒,在亚洲养鱼场造成了毁灭性的疾病。 我们长大了病毒(在实验室里),我与一家公司合作,该公司设法生产出可以预防鱼病的疫苗。

哪些病毒更可能扩散到人身上并引起疾病?

另一种冠状病毒或禽流感病毒。 他们是最危险的。 鸟类会散播禽流感病毒。 它们可以闩锁在我们下呼吸道的受体上,因此对他们而言溢出很容易,但它们却不容易在人与人之间传播。 在蝙蝠中,冠状病毒太多,它们可以将它们脱落。

NL63来自哪里?

蝙蝠很可能是蝙蝠,因为NL63样序列位于蝙蝠中。 虽然我没有采样或筛选蝙蝠。 我们知道NL63附着在ACE2受体上(如SARS-CoV-2)。 蝙蝠ACE2受体看起来很像人类ACE2,因此蝙蝠也是人类产生的NL63的来源也就不足为奇了。

病毒总是有害的吗

我有一个假设,即某些病毒可能是有益的。 我没有证据这只是一个假设,仅仅是因为某些病毒未能与疾病相关联,因此这些病毒可能是有益的,但是尚未对此进行研究。 我的小组正在进行有关此主题的工作。

那么,生活在我们体内的某些病毒不会引起疾病吗?

肠道中有很多病毒,粪便中有很多新型病毒。 它们是否与肠道中的细菌群落相互作用尚不清楚(某些病毒专门针对细菌并杀死它们,并以此方式可能影响我们肠道微生物组的组成)。 很高兴推测这些病毒可以帮助我们,它们是我们的一部分,没有它们我们就无法生存,但这是未知的。 我们血液中也有病毒,因此我们体内也有病毒。 这些之所以称为孤儿病毒,是因为它们与疾病无关。 我很想知道当我们有各种各样的病毒时,我们是否更健康。

van der Hoek博士获得了欧盟的资助 荣誉 项目。 如果您喜欢这篇文章,请考虑在社交媒体上分享。



This article – “问与答:如何追踪新病毒–并将其与疾病联系起来| 地平线杂志
” – was originally published in Horizon, the EU Research & Innovation magazine

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